W3tc – настолько отличный инструмент, сколько глюкавый и не документированный. На первый взгляд пользоваться им просто, на второй приходится читать руководства, на третий начинается битье головой об стол.
Не минимзируюся JS и CSS файлы
Правильно не минимизируются. Их надо добавлять вручную:
А точнее воспользоваться малоприметной, как-бы не относящейся к делу, кнопкой с невнятной подписью в самом верху страницы:

После этого список заполнится автоматически. При необходимости его можно будет отсортировать драг-н-дропом. Когда прийдет нужда добавить в список еще файлы это можно будет сделать либо вручную либо побороться с нечеловеческим разумом автора плагина: что-то покрасится в красный цвет, что-то отметится галочкой, в результате количество добавляемых файлов перевалит за две сотни при исходных двадцати.
Внезапно перестает работать редирект на CDN
Точнее все работает, загружается, выгружается, но сайт упорно берет файлы с исходного сайта. Причина тут:

Чтоы победить, надо почистить ошибки из очереди файлов на загрузку:

Валятся ошибки JS, ломаются шрифты
Никогда не включать удаление комментариев и новых строк для JS файлов. Заставлять CSS-кодера, заключать все параметры правил содержащие пробелы в кавычки.




